Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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