Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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