Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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HIF1AQ16665 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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