Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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