Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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