Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCDC6Q16204 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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