Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
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