Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms