Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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