Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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