Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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