Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms