Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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