Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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