Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms