Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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