Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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