Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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