Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTK7Q13308 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTK7Q13308 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTK7Q13308 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTK7Q13308 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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