Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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