Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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