Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms