Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms