Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 NDUFV1-204ENST00000524876 584 ntTSL 414.19□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-215ENST00000529867 582 ntTSL 312.71□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-224ENST00000532343 620 ntTSL 312.71□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-212ENST00000528328 477 ntTSL 412.41□□□□□ -0.424e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-214ENST00000528548 579 ntTSL 410.77□□□□□ -0.694e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-206ENST00000526138 557 ntTSL 48.13□□□□□ -1.114e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 ATP11A-213ENST00000489577 383 ntTSL 510.83□□□□□ -0.683e-23■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 HIF1A-211ENST00000557446 559 ntTSL 517.82■□□□□ 0.447e-6■■□□□ 12
SF3A3Q12874 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-6■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 SMG9-207ENST00000598860 574 ntTSL 29.71□□□□□ -0.867e-6■■□□□ 12
SF3A3Q12874 SMG9-206ENST00000597598 1077 ntTSL 59.24□□□□□ -0.937e-6■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.237e-6■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-12■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -05e-12■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 POFUT1-205ENST00000486717 959 ntTSL 215.04■□□□□ -08e-7■■□□□ 12
SF3A3Q12874 POFUT1-204ENST00000465791 768 ntTSL 312.8□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-10■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.172e-8■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 GPRC5C-208ENST00000581590 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 520■□□□□ 0.797e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-9■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.637e-9■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-9■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 GLDC-203ENST00000463305 652 ntTSL 313.23□□□□□ -0.297e-9■■□□□ 12
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SF3A3Q12874 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 212.35□□□□□ -0.437e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 NAA40-208ENST00000544138 808 ntTSL 412□□□□□ -0.497e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 211.82□□□□□ -0.527e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 CDT1-203ENST00000569140 571 ntTSL 311.77□□□□□ -0.537e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 NAA40-201ENST00000338447 4707 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.647e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 GLDC-213ENST00000639443 2727 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.677e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 NAA40-204ENST00000536939 567 ntTSL 210.49□□□□□ -0.737e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 QARS-225ENST00000634336 486 ntTSL 510.25□□□□□ -0.777e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 WDR73-220ENST00000561434 582 ntTSL 49.73□□□□□ -0.851e-6■■□□□ 12
SF3A3Q12874 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 49.39□□□□□ -0.917e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 QARS-224ENST00000497635 386 ntTSL 39.26□□□□□ -0.937e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -17e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 QARS-223ENST00000494984 679 ntTSL 28.64□□□□□ -1.037e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 GLDC-212ENST00000639364 3298 ntTSL 58.3□□□□□ -1.087e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 GLDC-221ENST00000640592 2828 ntTSL 57.99□□□□□ -1.137e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 GLDC-218ENST00000639954 3279 ntTSL 57.68□□□□□ -1.187e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 QARS-220ENST00000487495 451 ntTSL 37.64□□□□□ -1.197e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 46.12□□□□□ -1.437e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 55.76□□□□□ -1.497e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)5.58□□□□□ -1.527e-9■■□□□ 12
SF3A3Q12874 TRMT1-222ENST00000593157 2127 ntTSL 221.43■■□□□ 1.026e-8■■□□□ 12
SF3A3Q12874 TRMT1-211ENST00000588511 2251 ntTSL 520.87■□□□□ 0.936e-8■■□□□ 12
SF3A3Q12874 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-8■■□□□ 12
SF3A3Q12874 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.126e-8■■□□□ 12
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