Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms