Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms