Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms