Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms