Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms