Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms