Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms