Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms