Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms