Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms