Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTBN1Q01082 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms