Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP1Q00587 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms