Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms