Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTBP60709 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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