Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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