Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HK3P52790 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HK3P52790 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HK3P52790 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HK3P52790 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HK3P52790 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HK3P52790 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HK3P52790 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms