Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ME1P48163 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ME1P48163 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ME1P48163 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms