Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms