Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms