Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms