Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms