Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms