Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms