Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms