Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA3P25788 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms