Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms